Köpeklerde idrar yolu enfeksiyonunun ana nedeni, bakterilerin idrar yoluna girmesidir. Bu bakteriler, genellikle dışkı, cinsel ilişki, hijyenik olmayan koşullar veya idrar yollarını tahriş edebilecek faktörler nedeniyle idrar yollarına ulaşır. Diğer nedenler arasında üriner staz (idrarın yerinde durması), idrar taşı oluşumu, hormonal değişiklikler ve bağışıklık sistemi zayıflığı yer alabilir.